青山寺原名青山禪院，位於屯門區青山東麓，是「新安八景」之一的「杯渡禪蹤」。

南朝宋文帝劉義隆元嘉三年（426年），杯渡禪師病死，葬於舟山，半年後「復活」。

元嘉五年（428年）三月，杯渡禪師坐一隻大木杯南下雲遊，來到香港屯門區青山東麓一個大岩洞，岩洞深三尺，闊二丈，中有石台，杯渡禪師在此修行，晚年返回東南亞終老。

一位隱居尼姑在岩洞旁邊搭茅屋居住，岩洞額書「杯渡禪師」四字，人稱「杯渡庵」。

南朝劉宋末期（420年－479年），達摩祖師到訪「杯渡庵」，成為佛教教徒重要朝聖地，隋朝時改為普渡道場，唐朝改稱雲林寺。

唐朝末年，廣東省小諸侯國，南漢後主劉鋹（音倉）大寶十二年（969年），封青山為瑞應山，在山上建杯渡寺。

屯門縣官陳延下令鐫造杯渡禪師像，高五尺六寸，在「杯渡岩」石台供奉。

「杯渡岩」又稱「瑞應岩」、「石佛岩」，側邊有「高山弟一」四字石碑，旁有「退之」（韓愈的字)兩小字。

韓愈是唐代著名文學家，因勸諫皇帝不要迎接佛骨，被貶至廣東潮州任刺史，韓愈《贈別元十八協律》詩：「屯門雲雖高，亦映波濤沒。」，後人憑這句詩，認為他曾到過屯門，「高山弟一」可能出自韓愈手筆。

據考證，「高山弟一」為宋徽宗時代，居住在新界錦田的鄧符協，遊覽青山時在青山頂石崖，仿摹韓愈字體刻寫。

「高山弟一」石碑受風雨侵蝕殘缺，1919年，曹受培（號青山漁隱）摹拓舊碑，命工鑿石摩刻，置杯渡岩旁，碑後刻有韓愈五言律詩：
「兩巖雖雲牢，木石互飛發，屯門雖雲高，亦映波濤沒。」

（「高山弟一」中的「弟」字，被好事之徒改為「第」字，「弟」並非「第」的白字，而是本字）

北宋宣和元年（1119年），杯渡寺改為寺院道場，逼僧人易道服居住，詔改為斗姆宮，元、明兩朝，改稱青雲觀。

清朝初年因沿海遷界，青雲觀荒廢，道光九年（1829年），當地士紳重修，刻石額及鑄銅鐘以紀其事。

青雲觀主神為斗姆（又稱斗姥），供奉觀音菩薩、三帝、呂祖、王靈官、彌勒、朱立天君、濟公、關帝、泰國佛。

屯門陶氏善信題助田租，作為香火開支，陶氏每年於觀內舉行開燈儀式。

清光緒年間，黃姑（蓮慈）在青雲觀附近自建茅蓬居住。

民國初年，青雲觀仍為道場，時人稱為斗姆古廟，中奉斗姆及王靈官二神。

後人建有六柱六角亭，名「韓陵片石亭」，亭的北位附有「青山碑記」。

1914年，青雲觀委任香港商人陳春亭為主持，陳春亭是道教先天道道長，在香港及南洋群島有數萬徒眾，開始收購附近土地，準備擴展道觀。

陳春亭在油麻地設齋會，與張純白居士（張森泉，法號了幻）茹素修行。
一日，二人同遊青山，夜宿斗姆古廟，「夢山頂白雲有佛，冉冉降摩其頂」，醒後，以斗姆古廟可作修行之所，於「廟旁躬自荷鋤闢徑，邀友好籌資建寺」。

屯門陶氏族人尊奉陶淵明太公，東晉名將陶侃為始祖，斗姆古廟屬屯門陶氏族人，陶耀東、陶喜廷、陶殿貴、陶堂興等人產業。

1917年，業主以陳春亭為「正經慈善之人」。
「青山杯渡寺青雲觀廟宇，送與陳春亭主持，供奉神佛。陳春亭即補回公用銀叁佰六拾大圓，與陶姓眾等收接支用。其寺觀一概歸陳春亭主持司祝，任由重修整造，凡廟中所有四圍物產，亦歸陳春亭管理，每年收租納糧。」
陶氏同意「陶姓不得借端勒索，改換主持」，陳春亭不得「將寺觀司祝，私推與別人」。

1918年，陳春亭中途皈依佛教，遠赴寧波觀宗寺，禮天台宗諦閒法師座下出家，受三壇大戒，法號顯奇。

1926年，開第一期戒壇，盛況空前，中國佛門龍象太虛大師路經香港，目睹開戒規模大感讚歎︰「宛然一大叢林，嶺南佛教聯合會設其中。」

1928年，陳春亭與業主屯門陶氏，商議在斗姆古廟修建寺院。

前清遺老陳伯陶，《遊屯門青山贈陳春亭居士詩》所附小註云：山有杯渡寺、青雲觀，久廢，居士為之重葺。

1927年6月及1928年3月，第十七任港督金文泰兩度遊覽青山，對青山風景名勝甚為讚賞。
1929年，立牌坊於青山寺路上，題上「香海名山」四字。

1930年，各項工程完竣，稱為青山禪院，同時重修位於大雄寶殿旁破損的青雲觀，成為寺院內一所道觀，完工之日，屯門陶氏致送牌匾祝賀。

青山禪院與凌雲寺、寶蓮寺，合稱香港「三大名剎」。
三寺法師：青山禪院顯奇法師、寶蓮寺筏可老和尚、凌雲寺妙參法師，約定三年一度輪流傳戒，確立「三山開戒」模式。

青山禪院入院處牌樓正面「香海名山」四字，出自港督金文泰爵士，背面「回頭是岸」是六榕寺高僧鐵禪法師手筆。

（鐵禪法師，擅結交權貴，抗戰期間曾附敵。1942年4月，鐵禪來港宣揚佛法，進行「和平」活動，戰後被斥為「奸僧」。1946年6月，以漢奸罪判獄十五年，九月病死獄中，年八十一歲。）

牌坊外聯「樓觀參差，清夜聞鐘通下界，湖山如此，何時返錫到中原」，為當過袁世凱總統秘書長的梁士詒所題。

內聯「遵海而來，杯渡情依中國土，高山仰止，韓公名重異邦人」，出自前清遺老陳伯陶手筆。

內聯「岸泊屯門，幸我輩附韓子題名，卜異記山河並壽；亭觀海月，歎此地無坡公遊蹟，問何年笠履重來」，為前清遺老伍銓萃所題。

牌坊上瓦脊以石灣陶瓷雕像作裝飾，描述《封神榜》哪吒和雷震子故事。

山門門額「青山禪院」，寺門兩旁有對聯，「十里松杉藏古寺，百重雲水繞青山」。

青山禪院由多組建築物構成，群集於五百八十三米高的青山東面山麓上，大致包括三組建築群。

首組建築群包括「菩提薩埵殿」，內分陰老太爺殿，中間為地藏殿，最後為報恩堂，宿舍現作為藏書地方。

主殿大雄寶殿為寺院中心，殿內主壇上供奉三尊佛像：釋迦牟尼佛像、阿彌陀佛像、藥師佛像。

大雄寶殿屋脊上有亮麗石灣陶瓷塑像，四個向上翹的角上，置放用灰塑造的鳳凰。

屋頂上有「二龍爭珠」、「鯉魚戲水」雕塑，大雄寶殿前方為樓高兩層的護法殿，牆上漆有彌勒佛像，上層供奉韋陀大將軍。

大雄寶殿後有小路通荷花溪，溪畔有「龍骨岩」，岩內原放有龍骨化石一塊，傳說是史前恐龍化石，現置於護法殿下。

大雄寶殿旁為功德堂即祖堂，主要供奉歷代住持、法師等神位，功德堂前為客堂，接待各方善信，客堂旁為膳堂，側邊有達摩像。

第二組建築群包括已倒塌的方丈室、護法殿，護法殿下有「和合山門」，傳說會自動朝開暮合，對聯「淨土何須掃，空門不用關」由此而來。

第三組是位處最高的建築群，供居士靈修，只有單一的居士林，又稱「定厂（音崖）」。

1932年，青山禪院創院主持顯奇法師圓寂，了幻法師以當家名義主持寺務，青山禪院與青雲觀發生管理權糾紛。

杯渡岩與觀音閣之間，有兩塊天然岩石，彼此的頂端，互相交接，而非合攏，從下而上望，可見一線寬廣天空。
1947年，觀音閣重建，內有包公岩、月下老人祠，主室供奉千手觀音，側室供奉坐蓮觀音，杯渡岩前曠地，供奉一座宏偉四面佛雕像。

1963年開始，屯門陶氏與香港政府，就青雲觀土地業權談判，一直未能達成協議。

1967年，王羽的《獨臂刀》在青山禪院取景，1973年，李小龍電影《龍争虎鬥》在青山禪院取景。

1985年，青山禪院整體評為一級歷史建築，青雲觀作為青山禪院一部分，被評為香港一級歷史建築。

1992年2月26日，青雲觀業權交由法院仲裁，政府入稟要求將業權撥歸慈善信託基金。

1998年11月26日，法院判定青雲觀，屬屯門陶嘉儀祖（陶五柳堂）和陶族所有。
律政司司長提出上訴，長達九年三次訴訟，牽涉的費用龐大，單是陶氏一方律師費已高達四千萬元。

2000年12月22日，香港終審法院裁定，青雲觀土地業權及超逾三億元換地收益，歸陶嘉儀祖及陶氏宗族擁有。

2002年5月23日，高等法院判令，青山禪院為一公眾寺院，成立「青山寺慈善信託理事會」，以信託形式管理青山寺（不包括青雲觀），理事會有十四名成員，主要由香港政府委任。

2003年9月10日，理事會接管青山寺，隨即進行緊急維修工程及歷史考察，着手進行大型復修工程。
2003年12月，理事會成立秘書處。

2004年9月10日，理事會正式接管青山寺，進行《青山寺古物古蹟研究報告》，按不同建築物歷史價值、破損程度等，確定寺內各建築及物品的歷史價值。

2005年，當局選取一千四百四十四幢歷史建築，由專家小組深入評估，向古物諮詢委員會提交擬定評級，供委員會考慮及審議。

香海名山牌樓、大雄寶殿、地藏殿、山門、護法殿維持一級歷史建築評級。
不二法門牌樓、修道者及長者宿舍、客堂、宿舍、觀音閣獲評為二級歷史建築，功德堂獲三級歷史建築評級。

2006年8月8日，嶺南大學與青山寺慈善信託理事會，舉行青山寺文物研究簽約儀式。

2008年6月，原在護法殿下的和合山門，遷到不二法門前花園，石柱對聯原位於護法殿前，現重置於不二法門前方空園地。
不二法門原為藏經閣，現時只剩正面的牌樓，正面寫上「杯渡遺蹟」，背面是「不二法門」。

2009年9月，青山寺進行復修動土儀式，整項工程約需三千萬元。

青山寺
地址：新界屯門北青山東麓楊青路。
交通：從屯門市中心乘屯門輕鐵，在青山村站下車登山或乘的士直達寺前。
開放時間：星期一至日，上午六時至晚上六時。