朱居元是客家人，祖藉廣東長樂(五華)《朱氏族譜》記載，乾隆二十七年（1762年），朱居元與妻子鄧氏，攜同八子一女。
（八名兒子順序為：登鳳、鸞鳳、悅鳳、庚鳳、貴鳳、日鳳、仁鳳、祥鳳），由廣東長樂徒居香港島石塘(屈地街附近)。
乾隆三十六年(1771年)建村，稱為石塘咀。

石塘咀受到猛獸及海盜侵擾，朱居元一家遷居九龍半島沙埔仔（大埔碗窰），最後遷往香港島南面大浪頭海灣建村定居，村名叫鶴咀村，海灣叫鶴咀灣。

朱居元長子朱登鳳未有娶妻生子，第五子朱貴鳳在鶴咀灣出海喪生，第六子朱日鳳徒居大埔，失去聯絡，七子朱仁鳳移居飛鵝山大磡村，八子朱祥鳳搬往九龍城，只有第三房的朱鸞鳳、朱悅鳳、朱庚鳳，繼續在鶴咀村開墾。

鶴咀山一帶山石嶙峋，平地不多，沒有太多土地可供建屋、耕種，朱氏後人二十三人，在鶴咀村居住。

生活日漸富裕後，屢次遭到海盜滋擾，村民斥資興建花崗石更樓，高九米，闊約四米，更樓上設有炮孔，供村民窺伺及攻擊敵人，儲存村中財產，在強敵襲擊時作婦孺藏身之所，更樓其後設有課室，供鶴咀村兒童就讀。

1845年出版的地圖，英文命名為德忌笠角，取自1843年駐港英軍總司令，香港第一任副總督德己立爵士，中文名稱叫做鶴咀。

1875年4月16日，香港第一座燈塔啟用，名為鶴咀燈塔，編號158號，是一座花崗石築砌的圓筒形建築，高九點七米燈塔底座與拱形入口由粗琢石塊砌成，入口鐵門上方飾有幾何圖案。

1893年橫瀾燈塔啟用，鶴咀燈塔停止運作，（1975年改為自動化操作，燈塔再亮起燈光），（鶴咀燈塔是香港現存五座戰前燈塔之一
2005年列為法定古蹟）。

1939年3月7日，鶴咀炮台開始操習高射炮，為日軍入侵作好準備。

1941年，日軍攻入香港，英軍於鶴咀半島高地興建兩座炮台，名為博加拉及德己立炮台（鶴咀炮台），在附近岸邊設置機槍堡和探射燈台，增強鶴咀半島防禦能力，日軍最終沒有在港島南部登陸，這些設施未能發揮作用。

光復後，大東電報局（香港電訊、電訊盈科），在博加拉炮台舊址設立電話通訊站，地面衛星接收站及海底電纜站，外人到來需向有關方面申請。

1962年，鶴咀村約有五十七戶，三百名居民，半數為兒童，村民大部份受僱於大東電報局，鶴咀村兒童在鶴咀的臨時學校，筲箕灣或石澳就讀。

1965年1月，華民政務司麥道軻稱，政府正覓地及籌募基金，為鶴咀村興建小學，設一課室，上下午班合共可容九十名學童，校舍佔地11250平方呎，建築費63400元，大東電報局出資23000元，政府津貼31700元，餘額由村民籌募。

1967年2月16日，大東電報局總經理蘇以德，主持鶴咀村校舍奠基儀式。

1967年7月，香港大學麥基教授，計劃在鶴咀興建建築物，研究颱風對多層建築物的搖動影響。
建築物高達一百呎、佔地六十呎乘三十呎，建築費用二百萬元，部分費用由納菲爾德基金會，英國鋼鐵業聯會海外發展部，土木工程研究會、香港大學、港府負責。

1968年7月，大東電報局鶴咀電訊發射台建成，是一幢單層建築物，有八組發射機、天線部有六條天線，傳遞啟德機場發出的工作消息，口頭氣象廣播給予東南亞飛行中的航機，取代紅磡的發射台。
鶴咀發射台使用單錐型寬頻帶天線，對數式寬頻帶方向性天線，發送遠距離電報。

1969年5月，大東電報局，建成鶴咀人造衛星聯絡站（鶴咀衛星通訊站），香港可接收來自美國、澳洲、日本、泰國無線電視訊號。

1975年11月25日上午十時，位於鶴咀與螺洲之間航道上，安裝在花崗石塔的一座強力導航燈啟用，裝有二百五十瓦特注碘鎢絲燈泡，天氣晴朗時該燈的白光可照至十哩遠。

1980年，鶴咀村有六十多戶居民，大部分村民以種菜及養豬維生，村內炮台廢棄，小學亦已停辦。

4月，香港置地計劃收購鶴咀村土地，發展成佔地十三畝的高尚住宅區，設七十五幢獨立複式洋房、泳池及網球場等，預計1983年完成。

鶴咀村只有姓朱的原居民有地契，無地契村民說縱有錢賠也不願搬走，要求發展商撥地建屋，建屋計劃因而擱置。

1983年，港府傾向在赤鱲角建新機場。
立法局議員陳鑑泉，1971年至1975年任香港大東電報局職員會主席，建議在鶴咀以東十公里以外，填海製造一個島嶼興建新機場，擬議的工程為三公里寬，北為大頭洲，南為狗髀洲，向東延伸至香港水域最東處，形成七十五平方公里人工島。

陳鑑泉建議機場設於島的東面，呈圓形，設三條5.6公里長的跑道，建議未被接納。

1989年10月，香港大學在鶴咀設立海洋科學研究所，由太古集團捐贈一千一百七十萬元興建。

設有每分鐘泵送海水流量五十加侖大型水族箱，有三個辦公室、一個容納四十人的研討室，一個小型圖書館、實驗室。

翻新已荒廢的燈塔看更宿舍，建十間連書桌臥室，每間可住兩人，有廚房、飯廳等。

10月，英國太古集團董事長施懷雅，港大校長王賡武出席奠基儀式。

1990年10月，施懷雅、王賡武，研究所所長Brian S Morton教授主持開幕禮，名為太古海洋實驗室。

1994年，研究所擴建，中科院南海海洋研究所曲格平教授，施懷雅、王賡武主持擴建儀式，正式命名為太古海洋科學研究所。

為保育海洋資源及科學研究，教育市民愛護珍貴海洋資源，1996年7月，鶴咀設海岸保護區，總海域面積約二十公頃，是香港唯一一個海岸保護區。

東面界線由雙四門（蒲台島附近水域），延至鶴咀東面岸端，南伸至狗髀洲東南端，西面界線由無線電發射站對開石岬，伸至狗髀洲南端，陸地界線一般沿海岸的高潮線劃定。

鶴咀海岸保護區周邊有四種主要岩石種類，以岩石形成年代計算，最古老的是火山爆發形成的凝灰岩，依次是花崗閃長岩、流紋斑岩、玄武岩。

地貌方面，海岸保護區內有受風浪衝擊的石岸，是香港東南面海角和陸岬常見地形，陡斜的花崗石岸崎嶇不平，呈不規則石階狀，有高至一米的垂直面，亦有狹小的岩棚，海浪湧至時會形成臨時小水池。

保護區內的生物多樣性相當豐富，包括各種魚類、石珊瑚、軟珊瑚、柳珊瑚，海洋無脊椎動物，為保護區內重要生態，保護區內進行的活動，均受《海岸公園及海岸保護區規例》，(第476A章)規管。

當局不鼓勵公眾到鶴咀海岸保護區參觀，保護區範圍內沒有提供任何公共衞生設施，如廢物箱及廁所。

2004年，太古海洋科學研究所再次翻新，由太古集團出資，港大校長徐立之，太古集團主席何禮泰主持儀式。

鶴咀道迴旋處以南一段限制車輛出入，沿鶴咀道前行，全程為瀝青路，直行到底通往鶴咀海岸保護區。

經過幅射強勁的鶴咀高台發射站，到達鶴咀村，內有荒廢的鶴咀村學校，有一間士多，可以補給，之後到二級歷史建築鶴咀村更樓。

由更樓折返高台發射站，在鶴咀村路口及信箱之間24號渠道旁小路，經已荒廢的鶴咀下村，前往海邊的炮台，炮台左邊一座小碉堡，是海防測距站，由炮台折返，到達法定古蹟鶴咀燈塔。

離開燈塔沿大路行，到達鶴咀海岸保護區，旁邊豎立保護區範圍告示牌，左手面的大海蝕拱是雷音洞。
折回告示牌，左邊沿海岸行，可見於1955年在維港擱淺的長鬚鯨魚骨標本，（坊間誤傳為海洋公園的殺人鯨海威)，颱風山竹吹襲後，魚骨已所剩無幾。
靠左沿石灘進入是蟹洞，由蟹洞回到鶴咀道，全長約九公里。

鶴咀

交通：
筲箕灣巴士總站乘搭九號巴士（留意假日並非所有班次都經過鶴咀），特快旅遊路線X9投入服務，雙向繞經鶴咀站。

紅色小巴筲箕灣至石澳線（石澳巴士總站對出），紅色小巴旺角（雅蘭中心)至石澳線，於鶴咀下車。