西貢是傳統漁民村落，蠔涌、沙角尾、北港三地，南宋時已有村落。

明成祖永樂三年至明宣宗宣德八年，明朝政府派遣鄭和七次下西洋，不少東南亞、南亞、中東沿海、東非等國家，東來向明廷朝貢或貿易。
西貢一帶是西來朝貢船隻停泊的港口，因而成為一個繁華墟市。

外來貿易導致海盜掠奪商旅，明朝廷將西貢視作海防重地，西貢的龍船灣（糧船灣）與佛堂門，隸屬南頭寨六個水師汛地之一，駐兵二百一十人、戰船八艘。

目前最早記載「西貢」地名的《新安縣全圖》，有「西方來貢」意思，1866年由意大利傳教士獲朗他尼繪製。

西貢有較多外籍人士居住，可能與「西方來貢」歷史有關。

西貢墟天后廟創建於同治十一年（1872），原位於西貢海邊，當地稱為角頭廟。

閩南語中「角頭」是大區域中的小分區，居民來自同一個地方、或有相同姓氏、信仰。
「角頭」內奉祀從原鄉帶來的神明，所建的廟宇，稱為「角頭廟」，西貢墟這間「角頭廟」，供奉天后。

天后廟重建修碑記記載，天后廟於民國五年(1916年)遷到西貢墟。

廟內的捐款碑，刻鑿眾多商店名字，雜貨舖、茶樓、米舖、米箕一應俱全，由此可見當年西貢墟內商戶數量及繁盛程度。

天后廟門額為「天后古廟」，兩側對聯：聖蹟自莆田恩流貢土 慈雲開港海澤被岡州。

西晉末年，中原戰亂，中原先進生產技術和文化隨衣冠南渡，大批南下的漢人進入閩地，莆田是閩中一縣，從對聯推測，天后古廟內的天后來自莆田。

「貢土」是古代帝王分封諸侯時，按封地方位取一色泥土授與，供立社設壇，意思是要向朝廷進貢的土地。

「岡州」是廣東新會古稱，名字出現在隋朝到唐朝中期，為時甚短，推測是福建莆田人在隋朝到唐朝中期，經廣東新會，短暫逗留後來到香港西貢。

西貢居民對天后特別虔誠，每次出海或回來都要到天后廟祈福還神。

日軍侵港期間，西貢是抗日基地，天后廟在香港保衛戰中見證歷史。

1942年2月3日，「廣東人民抗日游擊總隊港九獨立大隊」（東江縱隊），在西貢黃毛應教堂成立，從事敵後工作，西貢居民英勇抗日，拯救英軍上校賴特等四人。

1947年4月，英軍代表李芝上將，把「忠勇誠愛」錦旗贈予西貢民眾，在天后廟前表揚他們在戰時協助盟軍的功績。

仁生堂藥材舖老闆李少欽，1941年，成立西貢商會，在天后古廟及協天宮內設立會址。

萬宜水庫興建時，李少欽帶領爛泥灣村村民遷到西貢市區，同時兼任街坊會總理，立公秤處理買賣糾紛，在天后廟興辦義學。

政府為安置受萬宜水庫工程影響村民，在西貢墟天后廟前填海，建成十幢五層高樓房，西貢墟居民認為會破壞天后廟風水，提出反對。
政府修改建屋計劃，留下一條「風水線」，由天后廟向東北伸延至西貢對開海面的羊洲，稱為「羊洲路」，天后娘娘可直望羊洲，視線不會受阻。（天后廟風水線的羊洲路，現已被高樹阻檔）

羊洲又名「獨鰲洲」，位於西貢碼頭對開海面約二百米處，每年都有過千隻麻鷹來香港過冬，島上僅有一墓，相傳墓主是為建風水墳買下全島。

1965年、1993年、2009年，天后廟都有重修記錄，資料相當完整，由重修興工拆卸、架馬修料，正座升樑、結砌神座，所擇吉日均有記錄。

天后廟內有三寶，包括：長籤、籤文，一個由美國海軍留下的銅鐘。

天后廟為兩進式建築，由於相連協天宮，構成罕見的五開間建築群，每間以鑊耳山牆分隔。

兩座廟宇由「西貢街坊值理會」管理，不僅是西貢區宗教中心，更是地區政治、經濟、鄉事、教育、醫療發祥地。

政府與華人廟宇委員會，多年來都要求接管天后古廟與協天宮，街坊會都嚴辭拒絕。

四月份每年一度天后寶誕，街坊會重金禮聘戲班，廟前上演神功戲，四日五夜，是街坊最期待的日子。

2008年，街坊會籌備維修天后古廟與協天宮，政府文物復修辦事處表示願意出資，修葺後天后廟交由政府部門管理。

街坊會拒絕，街坊自掏腰包，用了多年儲備，湊足三四百萬，終於成功維修，經過多次「眾籌」維修，天后廟牆上都刻滿街坊名字。

協天宮又稱關帝古廟，十九世紀初期，原位於油麻莆村內的「躉場」，即現時「西貢醫局」位置。

「躉場」是西貢墟制高點，抗日時期，游擊隊在「躉場」架設重機槍。

關帝古廟日久失修，鄉民集資重修，民國五年(1916年)天后廟重修，街坊將關帝請來成為天后娘娘鄰居，與天后古廟合建在一起。

協天宮門額為協天大帝，廟內祭祀關帝神像，右為關平，左為周倉，兩側對聯為清朝遺老廣東探花陳伯陶所寫：
正漢一心 貫徹千秋忠義氣
空曹兩目 看開萬古帝天模

西貢公立學校又名普通學校，意思是希望普通市民大眾也能接受教育。
1946年開辦，同年4月獲政府批准為津貼學校。
1950年，西貢地方人士召開會議，在天后廟側籌建新校舍。
1951年，普通道五十號新校址落成啟用。
1995年9月，普通學校與另外四間同區村校，合併為西貢中心李少欽紀念學校。

李少欽紀念學校，逾三份一學生為非華語學童，來自亞洲、歐洲、北美洲國家，除正規中文課程外，學校利用校本課程，從聽說、識字、閱讀、寫作、綜合能力等方面，逐步協助非華語學生學習中文。

（2018年5月17日，教育局局長楊潤雄訪問李少欽紀念學校）

2009年12月18日，西貢墟天后古廟及協天宮被列為二級歷史建築。

2016年11月17日至22日，天后古廟及協天宮百年慶典，西貢街坊會舉行一連六日活動，包括粵劇匯演、萬人盆菜宴、特色廟會攤位等，水陸巡遊為慶典掀高潮。

11月20日，天后娘娘和關帝爺爺首次水陸巡遊，吸引過萬人赴會。

個多小時的海上巡遊，經鹽田仔、羊洲，圍繞枕頭洲、半月灣背面及正面、橋咀，然後折返碼頭，繞西貢海一圈，象徵天后和關帝巡視海面，祈求心想事成。