香港海岸線漫長，多處皆適宜興建鹽場，北宋初年在現時九龍灣東南、西北、西南沿岸，尖沙咀與茶果嶺之間一帶，設立名為「官富場」的官方鹽場，範圍覆蓋今日觀塘區、九龍城區、油尖旺區，派造鹽官並駐兵，屬於廣州府東莞縣，鹽場為縣內四大鹽場之一。

宋恭帝德祐二年正月十八日（1276年2月4日），伯顏率領元朝大軍佔領南宋首都臨安，五歲小皇帝宋恭帝與謝太皇太后相繼被俘。
2月18日，元兵至臯亭山，宋遣監察御史楊應奎奉上傳國璽，宋恭帝投降元朝後封為「瀛國公」。

宋恭帝異母兄弟益王趙昰（音是）與廣王趙昺，在國舅楊亮節、朝臣陸秀夫、張世傑，陳宜中、文天祥等人護衛下南逃。

逃到金華，趙昰被封為天下兵馬都元帥，趙昺為副元帥，晉為衛王。
1276年6月14日，剛滿七歲的趙昰，在福州即皇帝位，是為宋端宗，改元景炎，冊母楊淑妃為皇太妃、同聽政。

景炎二年（1277年）四月，趙昰與趙昺及一眾大臣，逃到九龍灣，在離開海灘不遠地方，用木興建簡陋行宮，稱為「二王殿」，其後發展為「二王殿村」，有村民數百人，「二王殿村」傍有上帝廟。

九龍灣西岸有一座小山，位於今日宋皇臺道和譚公道、北帝街東北面，東面臨海，其餘三面是稻田和池塘，小山附近有一條小河流出九龍灣，叫馬頭涌。

小山高三十五米，周邊約六百米，山頂有一塊巨石，重約三百噸，巨石外表平滑，一半枕在山頂的大石上，其餘一半虛懸，由一顆小石卵支撐，巨石頂可容五十人，是九龍灣最高點。

宋端宗經常站在巨石上北望神州，巨石被稱為「宋王臺」（宋朝皇帝觀景臺），小山被稱為「二王殿山」（官富山）。

期間，楊淑妃女兒晉國公主墮海溺亡，找不到屍骸，臣民鑄金身塑像一座，墓塚設於宋王臺西北不遠的小丘上，建有一座大碑，人稱「金夫人墓」。(1917年，因建造教堂，「金夫人墓」被毀)

景炎三年（1278年），宋端宗崩，軍心渙散，無心戀戰，陸秀夫在碙州梅蔚（香港大嶼山梅窩），改碙州為祥龍縣（廣州為祥龍府），擁立趙昺為皇帝，是為宋少帝，改元「祥興」。

趙昺母俞修容下落不明，奉端宗母楊淑妃為太后，逃往新會厓山避難。

元朝命大將張弘範大舉進攻厓山，宋軍水師在張世傑指揮下與元朝軍隊交戰，史稱厓山戰役，宋軍全軍覆沒。

1279年3月19日，丞相陸秀夫見無法脫逃，背負剛滿八歲的趙昺跳海殉國，楊太后投海殉國，宋朝正式滅亡。

趙昺遺骸漂至赤灣附近，由僧人發現，認出身穿龍袍的是宋少帝，將他葬於深圳赤灣（南山區），現存宋少帝陵（祥興陵）。

「二王殿村」村民在巨石上刻「宋王臺」三字，紀念宋朝最後「二王」，為怕元朝官員追究，「二王殿村」改名「二黃店村」。

嘉慶十二年丁卯（1807年），廣東水陸路提督錢夢虎命新安營遊擊林孫，新安縣知事李維瑜及官富巡檢胡宏昭，重修巨石上的「宋王臺」三個字。

嘉慶二十四年（1819年），《新安縣志》記載：「宋王臺，在官富之東，有盤石，方平數丈。昔帝昺駐蹕於此，台側巨石舊有『宋王臺』三字。」

九龍灣一帶被連綿翠綠農田及梯田覆蓋，居民組成多條村落，包括衙前圍村、衙前塱村，東頭村、西頭村、沙埔村、鶴佬村、竹園村、石鼓壟村、打鼓嶺村等等。

1860年，清廷割讓九龍半島予英國，英人稱宋王臺為「聖山」。

不久，有人在聖山採石作建築材料，九龍城居民發起保存宋王臺運動，得到立法局華人議員何啟支持。

1898年8月15日，何啟在立法局提出動議，要求政府立法保存聖山。

1899年，立法局通過《保存宋王臺條例》，訂為法定保護古跡，禁止在宋王臺聖山採石，港英政府撥款在宋王臺四周加建圍牆及公園，豎立碑誌，嚴禁破壞。

1911年辛亥革命推翻清朝，不少清朝遺老到香港定居，定期到宋王臺，緬懷石上嘉慶年間留下的刻字。

1915年，香港大學教授賴際熙，是晚清進士、學者，曾任清朝國史館總纂，被尊稱為賴太史，籲請政府劃地數畝，保存「宋行宮故址」（宋王臺）。

港紳李瑞琴承辦港英政府建築工程致富，響應賴際熙呼籲，向港英政府捐款，修築石垣、牌坊、涼亭，環山頂巨石築成石基，建成公園。

1916年，工程大致完成，定名為「宋臺舊址」，賴際熙與陳步墀等一班舊式文人，在山頂宋王臺大石旁飲酒賦詩，欣賞汲水門的落日餘暉。

農曆九月十七日，滿清遺老陳伯陶邀集旅港廣東遺民，張學華、賴際熙、汪兆鏞、蘇澤東等十餘人，到宋王臺祭祀宋末東莞遺民趙秋曉生日，其後邀約粵港兩地其他遺民，互相憑弔宋末史跡，緬懷清室。

陳步墀是省港乾泰隆老闆，保良局總理，1920年代出版《宋臺集》，其中一幅繪於1917年的《宋臺秋唱圖》，清楚繪畫出「宋臺舊址」地理環境，建築布局，入口的牌坊門聯，花木景緻都繪畫詳盡。

1941年，日軍佔領香港期間，計劃在九龍灣機場擴建成兩條交叉跑道，有意炸毀「聖山」上面的巨石，用作舖設跑道之用。

1942年，日本陸軍省批准擴建機場。
1943年1月9日，近萬人參與機場擴建工程，當中包括英軍戰俘，經多次爆破，巨石被炸開裂成三份，被炸開的兩塊巨石，再經多次爆破，鑿成碎石後，用作舖設跑道。

刻有「宋王台」三字的大石排在最後爆破，日本士兵在大石埋好炸藥，導火線燒到中途無緣無故熄滅，連續幾次都是如此，只得返回軍營想辦法。

第二天，士兵拿炸藥炸石，一陣陰風從山上吹來，士兵一個一個暈倒，炸石工程中止。
第三天，日本佛教布教士宇津木二秀，以「前立本尊御遷座式」，安壇作法，法事完畢後再放置炸藥炸石，這次炸藥爆炸，但大石仍原好無缺，法師認為大石「有靈」，建議保留。

1944年10月16日下午約三時三十分，盟軍兵分兩路空襲香港，九龍灣機場被炸毀，擴建工程暫停。
1945年8月15日，日本宣布無條件投降。

香港光復後，港英政府繼續擴建機場，計劃炸毀「聖山」。
九龍城居民要求保留「聖山」，港英政府其後同意，將刻有「宋王台」三字的部份，削成一塊長方型大石，移到距「聖山」一百米地方，設置公園安放。

削石工程開始後，每天都有工業意外發生，工人無緣無故地吐血昏迷，甚至死亡，工程被逼停止，法師舉行祭石儀式，承諾會將方形大石放在公園內，工程得以順利進行。

1957年歲次丁酉冬月，新會簡又文撰文，台山趙超書丹，合力製作九龍宋皇臺遺址碑記，樹立在公園內。

碑記認為「宋王臺」是「宋皇臺」之誤，港英政府將將公園命名為宋皇臺公園。
1960年，開放給市民使用。

在香港居住的宋室後人，定期在宋王臺附近酒樓舉行祭祀，在會場擺放宋恭帝及宋帝昺畫像。

2014年4月21日，港鐵沙中線土瓜灣站地盤，發現三個地層古蹟，工程暫停。
考古學家到場，發現古蹟跨度由唐代至現代，包括1920年至1960年形成，位處最淺的「填土層」，中間「晚清民國層」、深入地底的「宋元層」。

掘出二百三十九個遺蹟及數千件出土文物，是過去六十年來，香港最重大考古發現。

宋元古蹟遺址有六個古井、麻石明渠，出土三千七百件重要器物、一千多箱普通器物，包括陶瓷器碎片、錢幣、鐵塊、木頭。

錢幣歷史由現代追溯至唐代，包括公元621年的「開元通寶」、「元豐通寶」與「紹聖元寶」，晚清的「乾隆通寶」，現代（1926年）香港一仙。

陶瓷主要來自福建晉江，磁竈（音灶）窰及浙江龍泉窰，大部分陶瓷碎片質量較普遍，估計是當時居民使用的生活用品。

當中較具價值，包括八卦紋青瓷香爐，龍泉外蓮瓣內底貼雙魚紋折沿盤碎片，展飾有模印雙魚及蓮瓣紋，魚紋代表富足，蓮花是宗教紋飾。

2014年11月22日，發展局局長陳茂波表示，沙中線土瓜灣站地盤內發現的七處遺蹟，宋元時期的古井不太整全，保育價值相對較低，對工程影響大，考慮拆卸覓地重置，與其他古物一併重置於宋皇臺公園內。

古井若易地重置，只需額外花費一千萬元，模擬度可達八成，若原址保留，額外開支高達十三億元。

2014年底，古物事務監督（發展局局長），決定將大部分宋皇臺站遺蹟原址保留，額外撥款四十一億，調整因考古發現導致的工程支出。

古物古蹟辦事處接納港鐵保育報告，原址保育其中兩口宋代古井，在大堂展示文物。

2021年6月27日，港鐵屯馬線開通，「土瓜灣站」改稱「宋皇臺站」，為港鐵首個設有文物館車站，港鐵大堂的「聖山遺粹」展覽，展出約四百件宋元時期出土文物。

古蹟辦執行秘書(古物古蹟)蕭麗娟表示，宋皇臺站古蹟遺址共發現七十萬件文物，古蹟辦挑選四百件作展品，包括：各種青釉瓷碎片、迷你陶骰、藥王像，兩個較完整的陶水管、瓦當，纏枝紋淺青釉梅瓶、茶具褐釉盞托等，五百個「宋元通寶」銅錢，十九世紀末至二十世紀日常用器等。

兩個元代八卦紋青瓷香爐，狀態較完整，於水井附近灰坑出土，或與水井神祭祀有關。