慈山寺位於大埔洞梓，俗稱「洞梓觀音寺」，背靠八仙嶺，面向船灣海，環境清幽。
玄學家指是「海螺吐肉」風水名穴，先人安葬於此地，後人必定丁財兩旺，海對面有島嶼，形成「觀音朝山」格局，有求必應，利於祈福和禪修。

2003年，香港經歷沙士恐慌，經濟非常低迷，香港首富長實主席李嘉誠，是正覺蓮社（1945年在香港成立）名譽顧問，決定斥資興建慈山寺，以清淨道場淨化人心。

1980年成立的李嘉誠基金會，是李嘉誠的「第三名兒子」，捐贈慈山寺全部發展經費（包括補地價、建築、道路工程等）。

覺光法師創辦的正覺蓮社，成立「香海正覺蓮社2003有限公司」，提出慈山寺發展計劃，推廣佛教，為善信提供靜修環境，不是旅遊項目，承諾不會興建骨灰龕，計劃引起環保團體與區內居民激烈反對。

2005年5月3日，覺光法師到大埔區議會，爭取區議員支持興建慈山寺與觀音像，承諾慈山寺會對外開放，但要預約方獲接待。

2006年1月3日，竹園區神召會大埔堂張德明牧師，向教徒發出呼籲信，反對興建巨型觀音銅像，2006年，慈山寺計劃獲城市規劃委員會通過。

2008年7月，政府以七千一百二十一萬元，批出洞梓五萬平方米土地予正覺蓮社，作宗教及僧侶宿舍等相關用途，為期五十年，條款沒要求慈山寺需向公眾開放，地政總署總監擁有酌情權決定土地用途。

2009年，「慈山寺有限公司」成立，十二名董事負責慈山寺計劃。

慈山寺總面積等於五個政府大球場，內有高度僅次於海南島一百零八米高觀音像，全球最高的七十六米戶外青銅觀音像。
觀音像旁邊有一座三層高大雄寶殿，與三座三層高僧侶宿舍，總樓面面積逾五千平方米，最多可以容納逾二千名善信。

2010年12月，俊和建築以四億二千二百萬元，投得慈山寺主要工程合約。
2011年3月開始動工，寺廟設計參考唐代寺院，包括打入世界文化遺產的五台山佛光寺。

2011年8月20日，《蘋果日報》以頭版報導，直指由覺光法師牽頭的慈山寺，實際是為李嘉誠興建私人陵園。

8月22日，慈山寺有限公司董事局主席釋覺光，在多份報章刊登聲明，直斥《蘋果日報》，嚴重損害慈山寺組織和李嘉誠名譽。

覺光法師表示，李嘉誠有此佛心很不可思議：「他一個人出錢，給全世界人禮佛，並無求回報。」

2012年11月4日，李嘉誠主持「入藏大典」，在觀音像正中央位置安放舍利子，僧侶在儀式後入住其中兩座宿舍。

2013年，慈山寺落成，耗資十五億元，是香港首間「供水」供佛的寺廟，實行「四不」措施，包括禁止未經預約拜訪，除佛誕及特別節慶，平日限額四百個，不准訪客燒香、不設齋堂、不招呼旅行團。

慈山寺雖不設齋堂，但有露天茶座，免費供應各式咖啡、熱茶、麵包，每日播放幾場七分鐘3D電影，寺內八百名義工的熱情友好招待，備受讚賞。

慈山寺分三個區，中間為主佛殿區，左邊為僧寮，右邊為觀音像區。

山門是慈山寺正門，牌匾「入解脱門」，代表慈悲、智慧、方便。
門外两尊外護法是哼哈二將，原是商紂王两位大將，受姜子牙列於封神榜，「入解脱門」後是「不二法門」牌匾。

過了山門是掛有「一生補處」牌匾的天王殿，「一生補處」菩薩就是彌勒佛，依照唐朝天冠彌勒佛像打造。

殿內有須彌山四大天王，分別持劍、挽琴、拿傘、握蛇，代表風調雨順，鎮守殿後的菩薩是金光閃閃內護法韋馱。

天王殿兩旁有鐘鼓樓，鐘樓下層是地藏殿，殿內題上李嘉誠最喜愛經文對聯。

地藏殿內供奉的地藏菩薩像，是寺內唯一用楠木造的佛像，依照唐代風格，左手拿珠，右手持杖，法相莊嚴雍容。

天王殿左面是藏經閣，右面是普門，正中是大雄寶殿。

大雄寶殿前的「大庭院」小廣場，地台以中國的波紋花崗岩舖設，象徵成佛路上明燈的八角形天燈，參照位於日本奈良的東大寺作品。

大雄名字源自印度伽那教教主，意思是包容及懾服大千世界。

大雄寶殿佔地約1,027平方米，樓高十八米，屋頂銀瓦來自日本有二百多年歷史的丸榮陶業，地板用瑞典獨家出產的礦石鋪設。

慈山寺建築設計及造像顧問、中大建築學院教授何培斌稱，大雄寶殿結合傳統及現代元素，殿堂八條支柱以非洲進口紫檀木包鋼造成。

殿內三尊金色大佛，正中是佛陀，左右分别是藥師佛及阿彌陀佛，三尊大佛表層貼光面金粉，與半啞色金箔的彩繪衣飾相互映襯，三尊大佛的蓮花狀寶蓋鍍上24K金。

佛陀下左右两旁分立迦葉和亞難尊者，大殿两側有青銅鑄造的仿唐十八羅漢，羅漢是跟隨佛陀得大智慧而成佛十六名僧人，宋代加伏虎及降龍成十八羅漢。

大殿背後安放三幅大型壁畫，是用高科技複製的敦煌莫哥窟壁畫經變圖，複製彌勒經變、文殊經變、普賢經變壁畫。
中間彩色的彌勒經變圖最為豐富，左右两幅是黑白線條普賢經變及文殊經變，大殿擺放國學大師饒宗頤手筆的《心經》。

寶殿後的華雨台是慈山寺終軸，圓形進口看出去是幽美的松石圈。

普門是觀音殿，位於大雄寶殿東側，是抄經的地方，供奉六臂如意輪觀音菩薩，木刻的觀音像，面目慈祥，思維圓满。

殿前直徑八米大圓池叫洛迦池，池壁高約半米，以觀音所居的洛迦山命名，四周地面，以石材鋪裝十一圈同心圓，池水流動時，地面同心圓化為漣漪，充滿禪意。

當年佛祖成道的菩提樹，有一株分枝在斯里蘭卡。
2012年，斯里蘭卡國王，將菩提樹分枝的折枝贈與慈山寺，在普門旁定植成功，枝葉都頗茂盛。

由普門至觀音像，有一條筆直大道名慈悲道，兩側種十八棵古羅漢松。
慈悲道中間，觀音聖像正前方，設有一個青銅製水盂， 名「千處應」，為參學者（進寺參觀或學習）供水之用。

參學者須穿有袖上衣、長褲、七分裙或七分褲，為免不敬，避免穿背心、短褲、短裙。

觀音在印度時期的造相為男相，傳入中國後直至唐朝末期，造像皆現男相，宋代初期，觀音像開始現女相。

殿後矗立的仿宋造型觀音像，坐北向南，與位於大嶼山的天壇大佛遙遙相對。
觀音像正中央位置有一個小房作「裝藏」，安置斯里蘭卡所贈舍利子和三套經書。

頭頂髮髻中現阿彌陀佛像，寓意無量法力庇佑眾生，右手握代表智慧的摩尼珠，左手持清灑世界的淨水瓶，頭部微微俯瞰眾生，法相慈悲，清淨莊嚴。

觀音像外色素白，身高七十米，包括三層青銅蓮台，立於六米高麻石圓形基座，以超過六百噸錫青銅鑄造，鑄造時要將像分為十一段，組件合計由一千二百多塊銅板構成。

觀音像內用鋼筋支撑，構造穩固，外噴塗火箭使用的白色氟碳自淨漆，雨水可冲洗觀音像污漬，二百年都毋須大維修。

觀音像底下是一條長數百米的「正念徑」，慢慢繞行一圈約四十五分鐘，入口處豎立一塊高半米石頭，刻着「行深般若」，取自《心經》。

2013年8月，俊和工程公司與長實集團，就工程改動所需額外費用對薄公堂。

法官最後判俊和可討回逾億元工程費，長實就工程沒依時完工及多項瑕疵反申索，折扣後須向俊和賠償九千七百萬元。

慈山寺內三間高設防僧寮因官司而曝光，僧寮樓高兩層，一樓有五間房，睡房連洗手間面積約三十平方米，放置一張雙人床、一部電視機、三台電話。
所有房間窗戶裝設防彈玻璃窗及嵌鋼板木門，僧寮門外設密碼及電閘，牆邊有閉路電視及感應器。

慈山寺秘書長倪啟瑞說：「預期會有外國政要或僧王來臨，他們對住宿保安有一定要求。」

9月17日，李嘉誠與傳媒會面時提到慈山寺：「我經歷風風雨雨咁多年，會唔會為咗一個陵，而起間寺呢？講出嚟都對人唔住啦！」
李嘉誠強調，建慈山寺是百分百為了香港人，至今已經動用了十五億元。

10月26日及27日，慈山寺舉行「船灣村民參觀慈山寺工地」活動，分四段時間接待二千六百名船灣一帶村民，他們來自二十條村及七個屋苑。

2015年4月，慈山寺正式對外開放。
4月15日，接待首批四百名預約參觀者，慈山寺是香港首家結合佛法與專業輔導的中心，開創「正法治療」先河，免費為受情緒困擾人士提供協助。

觀音像底蓮台內設兩層慈山寺佛教藝術博物館，藏品分別是李嘉誠個人向李嘉誠基金會的捐獻，李嘉誠基金會直接購藏的佛教文物，包括石像、木刻、瓷器等各式珍貴佛教文物，有佛菩薩藏品一百尊，輪流展出四十三卷敦煌手抄經。
展品從公元一世紀的中亞貴霜王朝，到現代的佛教藝術展品，來自內地、中亞、日本、泰國、尼泊爾等。

2018年，李嘉誠退休後全心投入基金會工作。
2019年3月27日，慈山寺舉行開光典禮、慈山寺佛教藝術博物館啟用儀式，李嘉誠廣邀各界好友出席，包括：香港特首林鄭月娥、中聯辦主任王志民、政界人士、藝人劉德華以嘉賓身份出席。

李嘉誠致辭時說，佛教哲理為他導航，渡過憂慮、恐懼和變遷：「把握好立身處世是一門藝術—『我是誰？』、『我應該怎樣活着？』、『怎樣有美好未來？』」

截至2020年12月，李嘉誠基金會累計捐款超過三十一億元，慈山寺已接待參學者逾一百三十萬人次，參學者可參加抄經、供水、行禪等活動。

慈山寺特別栽植五百株桃花，借供花為廣大香港人祈福。
2021年2月10日邀請傳媒到現場參觀，重塑唐代白居易筆下詩意：「人間四月芳菲盡，山寺桃花始盛開」。