警方將案件列謀殺案處理，灣仔警區重案組探員及鑑證科人員，通宵在現場蒐證。

科學鑑證專家譚志清，在單位走廊牆上發現一道刀痕，現場散布血跡，睡房、廚房、大門口均有血點。

睡房走廊牆角及房門上黏有戰秋霞髮絲，房內的床上，發現一柄長三十厘米染血菜刀，未察覺單位內有人試圖清洗血跡。

根據睡房內及房門罅濺出血跡情況，推論案發時睡房門關上，估計戰秋霞先在床上遇襲，被王哲軍拖至床尾作第二輪襲擊，戰秋霞跌在地上，再遭第三輪襲擊。
由於屍體躺着位置阻擋房門出路，王哲軍移開屍體，開門離開。

睡房至廚房走廊有血腳印，按照血腳印深淺變化推論，王哲軍行兇後離開睡房，再到廚房內徘徊。

廚房內一個鑊鏟及一支萬能膠，沾有王哲軍及戰秋霞血跡。
單位外二十七樓至五樓樓梯欄桿，發現王哲軍血跡，推斷王哲軍行兇後手部受傷，未有包紮就沿樓梯往下走。

淩晨四時，戰秋霞屍體由仵工移送西環殮房，法醫驗屍時發現戰秋霞身中逾一百五十刀，主要在頭和頸部，額頭傷口超過二十條，最長一條長十厘米，由鼻樑直到嘴巴。

前頸一幅面積達22厘米乘15厘米大片傷勢，由二十多刀造成，右下巴有二十處長短方向不一傷口，後腦被斬二十多刀，頭部血肉模糊，面容被斬至毀爛不堪。

戰秋霞沒有防禦傷，相信在睡夢中遇襲，最先是面對面遭王哲軍襲擊，及後失去知覺，雖然沒有主要血管被割斷，但因傷口太多，終因失血過多致死。

基因化驗發現，戰秋霞的衣物、手鐲、指甲，王哲軍的衣物、單位內的紙巾盒，均沾有兩人血跡。

青山醫院醫生認為王哲軍可能患有精神病，包括妄想及幻聽。

中文大學情緒健康中心主管李誠教授指出，王哲軍曾在內地及海外求診，發病頻率似乎不高，沒有長時間接受觀察及治療。

推斷王哲軍是急性精神病發作，腦部機能急性失調，成因可能是遭遇巨大事故，例如天災，被禁錮遭到虐待、家人身亡、濫藥或遺傳。

急性精神病特點是在幾日內發病，幾日後又自然好番「無事一樣」，徵狀與一般精神病無分別，例如有幻覺、妄想、語無倫次等，一百個精神病人中，約有五個是急性精神病。

由於病發來去突然，有患者誤以為是「撞邪、鬼上身」，以致沒有求診或沒有持續覆診，導致病情反覆，患者只要接受醫生勸解，定時服藥，可以治癒。

香港精神健康促進會主席陳仲謀稱，精神病患者有不同徵狀，包括緊張、焦慮、思覺失調、妄想等，現時香港因壓力而患上精神病的專業人士，主要是教師和社工，保險業相對未見嚴重。

2月27日，王哲軍仍在青山醫院接受觀察，警方正式落案起訴王哲軍謀殺罪名。

王憲章知道兒子殺死母親，當場暈倒，因傷心過度，未能到港辦理喪事，中央統戰部人員陪同王憲章次子夫婦，戰秋霞胞妹到香港辦理後事。

2月28日，王哲軍在東區法院提堂，法庭翻譯員宣讀控罪，問王哲軍是否明白，王哲軍屢次以普通話說：「我不明白。」
經律師解釋後，王哲軍表示明白控罪內容。

翻譯員解釋控罪後，王哲軍緊張地以普通話說：「我沒有謀殺戰秋霞。」
隨即以英語說：「I want to … I want to …（我想…我想… ） 」
王哲軍有律師代表，法庭未批准他繼續發言。

主任裁判官鄧立泰，下令先索閱王哲軍兩份精神科醫生報告，將他還押小欖精神病院，3月13日再提堂。

王憲章來港後，到小欖精神病院探望王哲軍，王哲軍痛哭流涕，跪在地上不停地叩頭，兩人甚麼都沒講，哭了二十分鐘。

法庭索閱王哲軍精神報告，報告指出王哲軍適宜答辯。

4月10日，王哲軍於東區法院再提堂，在庭上不斷以英語高呼：「日本人殺了我全家，我沒有病，我是被下毒。法官大人，你要相信我，我需要你保護…」

庭警將王哲軍拉回羈留室，案件於5月16日在東區法院進行交付審訊程序，王哲軍還押懲教署看管。

王憲章因事件心情沉重，期間曾動手術，將妻子遺體送回家鄉大連安葬。

2009年3月10日，案件在高等法院開審，王哲軍否認謀殺，法庭選出四女三男陪審團裁決。

主控官開案時指出，王哲軍（37歲）狂斬戰秋霞超過一百五十刀，明顯是想令戰秋霞受重創。

王哲軍的精神狀況是本案重大爭議，主控官說，王哲軍的錄影會面，可見當時的精神狀態穩定，並非在沒有意識下殺人。

王哲軍平靜坐在犯人檻內，細聽翻譯員為他把供詞翻譯成普通話。

主控官向陪審團呈上證物，包括警方事後拍攝的兇案現場照片，處處血跡斑斑，還有死者的血肉模糊照片，主控官表明，相片看後或令人感到不適。

主審法官麥明康向陪審團表示，若看後感難堪或不適，可退庭稍作休息，不過，未有陪審員提出休息要求。

3月12日，高等法院傳召王憲章作供，王憲章在庭上憶述與戰秋霞最後一次通電話時，幾乎流出眼淚，認為自己保護不到妻子，沒有關心兒子，如果判處兒子有罪，倒不如判自己有罪。

王憲章強調王哲軍一直備受精神病困擾：「他被捕時一身穿戴並不正常，，襲擊母親時又砍下百多刀，如果要殺人，根本不用如此。」

馬燦文出庭作供時說，王哲軍侍母至孝，上街時會攙扶母親，會為母親購買昂貴的絲巾。

王哲軍的上司林海利作供時指出，王哲軍是一名斯文又負責任的員工。

3月13日，精神科專家李德誠及麥列菲菲出庭作證，兩人與王哲軍會面後，根據說話內容分析，兩人一致同意，王哲軍行兇時患有妄想型精神分裂癥。

李德誠認為王哲軍的情況，符合妄想型精神分裂癥十二項病徵，包括：妄想被逼害、妄想壞人假扮其親人、妄想被人控制、妄想被媒體談論、妄想被人看穿思想、妄想被人「提取」思想、妄想被人「輸入」思想、妄想其思想被人廣播出去、幻聽、激動失控、失眠、自殺傾向。

李德誠認為，王哲軍病情達到最嚴重程度，案發時可能已嚴重至不知自己的行為，王哲軍在妄想停止後，對自己的行為有片段性記憶，所以承認殺了人。

麥列菲菲則說，王哲軍患有緊張性精神分裂癥，出現妄想及幻聽等病徵，不時會聽到有聲音要他自殺，妄想「日本間諜已經控制一切」、「要替中國對抗日本」。

王哲軍在毫無先兆下突然病發，變得敏感及不相信任何人，行動可能變得極具攻擊性，相信戰秋霞來訪時，王哲軍突然病發引致慘劇出現。

案發時，王哲軍知道自己用刀襲擊戰秋霞，但覺得只是出於自衛，案發後兩個月，王哲軍仍不相信自己殺死母親。
麥列菲菲認為，無論王哲軍是否同意，都必須即時留院接受治療。

3月17日，法官麥明康引導陪審團裁決時表示，陪審團如要裁定因精神錯亂而不能定罪，要考慮王哲軍是否有精神病，精神病有否影響理性思考，行兇時知否自己斬人，知否斬人是錯的事。

陪審團退庭商議三個多小時後，一致裁定王哲軍基於精神錯亂而殺人，裁定謀殺罪名不成立。

法官認為王哲軍精神狀況仍欠理想，或對公眾構成危險，考慮是否應頒下醫院令，下令王哲軍進入精神病院接受治療，應辯方要求再徵詢精神科專家意見，案件押後至3月24日判刑。

王哲軍二叔王雙慶，案件開審後風雨不改地到庭，滿意裁決結果，趨前與控辯雙方律師握手道謝，感謝他們幫助。

王雙慶說，王哲軍自幼在內地長大，家屬希望王哲軍能返回內地醫治，有親友照顧，對病情有幫助。

3月18日，王憲章向傳媒發表公開信，懊悔沒有盡父親責任，自責說：「最對不起妻子，她用生命的代價，來換取我們關注哲軍的健康
後悔未有及時為兒子醫治，以致一發不可收拾。」

「香港高等法院宣判我的兒子王哲軍無罪，我終於可以對愛子如命、九泉之下的妻子，多少能有個交代了。」

「香港是個法制社會，案件審判過程證明香港司法公正，特別感謝大法官、陪審團，控辯雙方大律師、律師，站在人道主義角度，做出公正裁決。」

王憲章指出，慘案為他一家帶來常人難以想像的痛苦和壓力，社會和媒體的關懷與同情，令他們感到安慰，呼籲父母要時時關心子女身心健康，以免類似悲劇重演。

王憲章接受《蘋果日報》採訪時說：「你別看哲軍三十七歲人，對他媽媽是很依賴，大小事情，都會跟他媽媽商量，2007年母親生日
兒子特意買了一隻Tiffany戒指送給母親，當時母親如獲至寶，這也是她收到的最後一份生日禮物。」

3月24日，法官收到辯方兩名精神科專家報告，包括精神科專家李德誠及醫委會主席麥列菲菲，報告建議王哲軍無限期接受治療。
李德誠的報告認為，將王哲軍送返上海接受治療會較佳。
法官表示，將王哲軍送返上海接受治療的做法不可行。

法官比對控方早前提交的兩名精神科醫生意見，接納專家指王哲軍有重犯可能，平衡過王哲軍與社會公眾利益後，認為王哲軍適合無限期住院接受精神治療，根據《精神健康條例》頒醫院令，王哲軍無限期羈留在小欖精神病中心，期間由覆核委員會評核狀況，決定何時釋放。

王憲章因旅行證件到期，未能來香港聽判，王雙慶聞判後表示早已預期有此結果，王哲軍在香港沒有親友，甚為可憐，希望把王哲軍接回內地接受治療。

2020年8月14日，王憲章（78歲）於北京市中日友好醫院病逝。